Історія розповідає про героїчні зусилля кріптозоологіческого агентства «Монарх» щодо стримування гігантських монстрів. Цього разу проти могутнього Годзілли виступають Мотра, Родан і ультимативний кайдзю - трьохголовий монстр Кінг Гідора. Коли ці стародавні суперхижаки, які з часом перетворилися в напівзабуті міфи, повстають знову, щоб зійтися в сутичці, людству залишається відійти в сторону і постаратися не загинути.